Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vsnl1P62761 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vsnl1P62761 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms