Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpeP62305 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpeP62305 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms