Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrch1P62046 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrch1P62046 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrch1P62046 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms