Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vbp1P61759 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vbp1P61759 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vbp1P61759 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vbp1P61759 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vbp1P61759 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vbp1P61759 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vbp1P61759 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vbp1P61759 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vbp1P61759 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vbp1P61759 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vbp1P61759 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vbp1P61759 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vbp1P61759 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vbp1P61759 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vbp1P61759 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms