Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2fP61219 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Polr2fP61219 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.1 ms