Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sf3b6P59708 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b6P59708 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3b6P59708 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms