Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dpf3P58269 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dpf3P58269 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dpf3P58269 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms