Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp25P57080 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp25P57080 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp25P57080 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp25P57080 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp25P57080 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp25P57080 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp25P57080 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms