Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd5P56812 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd5P56812 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms