Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gp1bbP56400 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gp1bbP56400 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms