Protein–RNA interactions for Protein: P56390

Cks2, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cks2P56390 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cks2P56390 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cks2P56390 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cks2P56390 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cks2P56390 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cks2P56390 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cks2P56390 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cks2P56390 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cks2P56390 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms