Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Abcd3P55096 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms