Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GemP55041 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GemP55041 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GemP55041 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GemP55041 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GemP55041 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GemP55041 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GemP55041 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GemP55041 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GemP55041 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GemP55041 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GemP55041 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GemP55041 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GemP55041 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GemP55041 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GemP55041 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GemP55041 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GemP55041 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GemP55041 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GemP55041 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GemP55041 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GemP55041 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GemP55041 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GemP55041 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GemP55041 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GemP55041 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GemP55041 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GemP55041 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GemP55041 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GemP55041 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GemP55041 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GemP55041 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GemP55041 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GemP55041 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GemP55041 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GemP55041 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GemP55041 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GemP55041 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GemP55041 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GemP55041 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GemP55041 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GemP55041 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GemP55041 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GemP55041 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GemP55041 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GemP55041 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GemP55041 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GemP55041 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GemP55041 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GemP55041 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GemP55041 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GemP55041 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GemP55041 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GemP55041 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GemP55041 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GemP55041 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GemP55041 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GemP55041 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GemP55041 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GemP55041 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GemP55041 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GemP55041 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GemP55041 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GemP55041 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GemP55041 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GemP55041 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GemP55041 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GemP55041 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GemP55041 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GemP55041 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GemP55041 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GemP55041 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GemP55041 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GemP55041 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GemP55041 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GemP55041 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GemP55041 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GemP55041 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GemP55041 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GemP55041 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GemP55041 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GemP55041 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GemP55041 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GemP55041 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GemP55041 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GemP55041 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms