Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acod1P54987 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acod1P54987 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acod1P54987 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Acod1P54987 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acod1P54987 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acod1P54987 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acod1P54987 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acod1P54987 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms