Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb4P54761 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ephb4P54761 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ephb4P54761 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms