Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nub1P54729 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nub1P54729 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nub1P54729 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nub1P54729 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nub1P54729 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nub1P54729 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nub1P54729 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nub1P54729 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nub1P54729 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms