Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rad23bP54728 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Rad23bP54728 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rad23bP54728 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad23bP54728 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms