Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PitpnbP53811 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PitpnbP53811 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms