Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efnb1P52795 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb1P52795 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms