Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SqleP52019 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SqleP52019 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SqleP52019 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SqleP52019 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SqleP52019 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SqleP52019 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SqleP52019 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SqleP52019 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SqleP52019 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SqleP52019 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SqleP52019 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SqleP52019 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SqleP52019 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SqleP52019 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SqleP52019 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SqleP52019 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SqleP52019 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SqleP52019 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SqleP52019 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SqleP52019 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SqleP52019 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SqleP52019 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SqleP52019 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SqleP52019 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SqleP52019 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SqleP52019 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SqleP52019 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SqleP52019 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SqleP52019 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SqleP52019 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SqleP52019 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SqleP52019 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SqleP52019 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SqleP52019 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SqleP52019 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SqleP52019 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SqleP52019 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SqleP52019 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SqleP52019 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SqleP52019 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SqleP52019 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SqleP52019 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SqleP52019 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SqleP52019 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SqleP52019 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SqleP52019 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SqleP52019 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SqleP52019 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SqleP52019 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SqleP52019 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SqleP52019 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SqleP52019 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SqleP52019 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SqleP52019 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SqleP52019 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SqleP52019 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SqleP52019 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SqleP52019 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SqleP52019 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SqleP52019 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SqleP52019 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SqleP52019 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SqleP52019 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SqleP52019 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SqleP52019 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SqleP52019 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SqleP52019 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SqleP52019 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SqleP52019 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SqleP52019 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SqleP52019 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SqleP52019 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SqleP52019 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SqleP52019 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SqleP52019 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SqleP52019 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SqleP52019 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SqleP52019 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SqleP52019 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SqleP52019 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SqleP52019 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SqleP52019 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SqleP52019 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SqleP52019 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms