Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RorcP51450 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RorcP51450 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RorcP51450 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RorcP51450 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RorcP51450 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RorcP51450 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RorcP51450 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RorcP51450 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RorcP51450 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RorcP51450 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RorcP51450 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RorcP51450 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RorcP51450 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RorcP51450 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RorcP51450 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RorcP51450 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RorcP51450 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RorcP51450 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RorcP51450 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RorcP51450 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RorcP51450 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RorcP51450 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RorcP51450 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RorcP51450 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RorcP51450 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RorcP51450 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RorcP51450 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RorcP51450 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RorcP51450 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RorcP51450 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RorcP51450 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RorcP51450 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RorcP51450 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RorcP51450 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RorcP51450 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RorcP51450 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RorcP51450 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RorcP51450 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RorcP51450 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RorcP51450 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RorcP51450 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RorcP51450 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RorcP51450 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RorcP51450 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RorcP51450 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RorcP51450 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RorcP51450 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RorcP51450 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RorcP51450 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RorcP51450 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RorcP51450 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RorcP51450 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RorcP51450 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RorcP51450 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RorcP51450 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorcP51450 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorcP51450 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorcP51450 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorcP51450 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorcP51450 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorcP51450 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorcP51450 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorcP51450 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RorcP51450 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RorcP51450 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorcP51450 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorcP51450 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorcP51450 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorcP51450 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorcP51450 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorcP51450 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorcP51450 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RorcP51450 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorcP51450 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RorcP51450 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorcP51450 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorcP51450 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorcP51450 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorcP51450 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorcP51450 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorcP51450 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorcP51450 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RorcP51450 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RorcP51450 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RorcP51450 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms