Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc13P50207 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc13P50207 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms