Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnni3P48787 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnni3P48787 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms