Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Brca1P48754 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Brca1P48754 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Brca1P48754 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brca1P48754 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brca1P48754 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brca1P48754 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brca1P48754 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brca1P48754 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brca1P48754 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brca1P48754 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brca1P48754 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brca1P48754 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Brca1P48754 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brca1P48754 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brca1P48754 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brca1P48754 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brca1P48754 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brca1P48754 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms