Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcd1P48410 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms