Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx1P48377 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx1P48377 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms