Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl11P48298 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl11P48298 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl11P48298 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl11P48298 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl11P48298 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl11P48298 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms