Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpiaP47968 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RpiaP47968 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RpiaP47968 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RpiaP47968 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpiaP47968 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpiaP47968 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpiaP47968 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpiaP47968 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RpiaP47968 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpiaP47968 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpiaP47968 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RpiaP47968 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms