Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gli1P47806 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gli1P47806 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gli1P47806 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gli1P47806 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli1P47806 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gli1P47806 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gli1P47806 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gli1P47806 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gli1P47806 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gli1P47806 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms