Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrprbP47758 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrprbP47758 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SrprbP47758 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrprbP47758 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrprbP47758 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrprbP47758 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrprbP47758 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SrprbP47758 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrprbP47758 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrprbP47758 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrprbP47758 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrprbP47758 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SrprbP47758 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrprbP47758 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SrprbP47758 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms