Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfsf4P43488 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfsf4P43488 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnfsf4P43488 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms