Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sdc2P43407 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdc2P43407 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms