Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtgfrP43117 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtgfrP43117 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtgfrP43117 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms