Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HttP42859 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HttP42859 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HttP42859 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HttP42859 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HttP42859 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HttP42859 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HttP42859 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HttP42859 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HttP42859 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HttP42859 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HttP42859 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HttP42859 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HttP42859 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HttP42859 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HttP42859 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HttP42859 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HttP42859 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HttP42859 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HttP42859 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HttP42859 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HttP42859 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HttP42859 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HttP42859 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HttP42859 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HttP42859 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HttP42859 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HttP42859 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HttP42859 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HttP42859 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HttP42859 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HttP42859 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HttP42859 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HttP42859 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HttP42859 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HttP42859 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HttP42859 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HttP42859 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HttP42859 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HttP42859 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HttP42859 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HttP42859 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HttP42859 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HttP42859 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HttP42859 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HttP42859 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HttP42859 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HttP42859 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HttP42859 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HttP42859 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HttP42859 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HttP42859 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HttP42859 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HttP42859 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HttP42859 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HttP42859 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HttP42859 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HttP42859 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HttP42859 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HttP42859 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HttP42859 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HttP42859 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HttP42859 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HttP42859 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HttP42859 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HttP42859 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HttP42859 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HttP42859 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HttP42859 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HttP42859 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HttP42859 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HttP42859 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HttP42859 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HttP42859 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HttP42859 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HttP42859 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HttP42859 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HttP42859 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HttP42859 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HttP42859 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HttP42859 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HttP42859 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HttP42859 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HttP42859 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HttP42859 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HttP42859 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HttP42859 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HttP42859 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HttP42859 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HttP42859 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HttP42859 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HttP42859 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HttP42859 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HttP42859 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HttP42859 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HttP42859 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HttP42859 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HttP42859 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HttP42859 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HttP42859 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms