Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Etv1P41164 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Etv1P41164 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Etv1P41164 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Etv1P41164 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Etv1P41164 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Etv1P41164 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Etv1P41164 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv1P41164 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv1P41164 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms