Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbP41155 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbP41155 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbP41155 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbP41155 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbP41155 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbP41155 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbP41155 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbP41155 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbP41155 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbP41155 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbP41155 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LtbP41155 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LtbP41155 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LtbP41155 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LtbP41155 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LtbP41155 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LtbP41155 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LtbP41155 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LtbP41155 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LtbP41155 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LtbP41155 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LtbP41155 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LtbP41155 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LtbP41155 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LtbP41155 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LtbP41155 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LtbP41155 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LtbP41155 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LtbP41155 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LtbP41155 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LtbP41155 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LtbP41155 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LtbP41155 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LtbP41155 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LtbP41155 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LtbP41155 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LtbP41155 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LtbP41155 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LtbP41155 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LtbP41155 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LtbP41155 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LtbP41155 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LtbP41155 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LtbP41155 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LtbP41155 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LtbP41155 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LtbP41155 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LtbP41155 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LtbP41155 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbP41155 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbP41155 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbP41155 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbP41155 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbP41155 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbP41155 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbP41155 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbP41155 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbP41155 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbP41155 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbP41155 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbP41155 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbP41155 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbP41155 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbP41155 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbP41155 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbP41155 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbP41155 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbP41155 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbP41155 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbP41155 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbP41155 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbP41155 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbP41155 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbP41155 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbP41155 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbP41155 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbP41155 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbP41155 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LtbP41155 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LtbP41155 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LtbP41155 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LtbP41155 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LtbP41155 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LtbP41155 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LtbP41155 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms