Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt4P40749 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt4P40749 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt4P40749 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt4P40749 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syt4P40749 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syt4P40749 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syt4P40749 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syt4P40749 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syt4P40749 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syt4P40749 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syt4P40749 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syt4P40749 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syt4P40749 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syt4P40749 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syt4P40749 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syt4P40749 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syt4P40749 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syt4P40749 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syt4P40749 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syt4P40749 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms