Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VhlP40338 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VhlP40338 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VhlP40338 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VhlP40338 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VhlP40338 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VhlP40338 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VhlP40338 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VhlP40338 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VhlP40338 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VhlP40338 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VhlP40338 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VhlP40338 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VhlP40338 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VhlP40338 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VhlP40338 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VhlP40338 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VhlP40338 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VhlP40338 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VhlP40338 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VhlP40338 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VhlP40338 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VhlP40338 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VhlP40338 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VhlP40338 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VhlP40338 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VhlP40338 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VhlP40338 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VhlP40338 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VhlP40338 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
VhlP40338 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VhlP40338 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VhlP40338 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VhlP40338 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VhlP40338 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VhlP40338 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VhlP40338 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VhlP40338 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VhlP40338 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VhlP40338 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VhlP40338 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VhlP40338 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VhlP40338 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VhlP40338 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VhlP40338 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VhlP40338 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VhlP40338 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VhlP40338 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VhlP40338 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VhlP40338 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VhlP40338 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VhlP40338 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VhlP40338 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VhlP40338 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VhlP40338 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VhlP40338 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VhlP40338 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VhlP40338 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VhlP40338 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VhlP40338 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VhlP40338 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VhlP40338 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VhlP40338 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VhlP40338 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VhlP40338 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VhlP40338 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VhlP40338 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VhlP40338 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VhlP40338 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VhlP40338 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VhlP40338 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VhlP40338 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VhlP40338 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VhlP40338 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VhlP40338 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VhlP40338 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VhlP40338 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VhlP40338 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VhlP40338 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VhlP40338 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VhlP40338 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VhlP40338 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VhlP40338 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VhlP40338 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VhlP40338 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VhlP40338 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms