Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ThpoP40226 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ThpoP40226 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ThpoP40226 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ThpoP40226 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ThpoP40226 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ThpoP40226 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ThpoP40226 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ThpoP40226 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ThpoP40226 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ThpoP40226 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ThpoP40226 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ThpoP40226 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms