Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfc1P35601 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms