Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd22P35329 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd22P35329 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd22P35329 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd22P35329 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd22P35329 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd22P35329 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd22P35329 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cd22P35329 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cd22P35329 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd22P35329 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd22P35329 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd22P35329 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd22P35329 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd22P35329 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms