Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptpn11P35235 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms