Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stfa1P35175 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stfa1P35175 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stfa1P35175 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stfa1P35175 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stfa1P35175 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stfa1P35175 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stfa1P35175 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stfa1P35175 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Stfa1P35175 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stfa1P35175 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stfa1P35175 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stfa1P35175 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stfa1P35175 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stfa1P35175 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa1P35175 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa1P35175 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa1P35175 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa1P35175 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa1P35175 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa1P35175 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa1P35175 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms