Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stfa3P35173 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms