Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptk2P34152 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptk2P34152 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms