Protein–RNA interactions for Protein: P32020

Scp2, Non-specific lipid-transfer protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2P32020 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scp2P32020 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scp2P32020 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scp2P32020 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scp2P32020 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scp2P32020 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scp2P32020 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scp2P32020 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scp2P32020 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scp2P32020 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scp2P32020 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scp2P32020 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scp2P32020 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scp2P32020 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scp2P32020 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scp2P32020 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scp2P32020 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scp2P32020 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scp2P32020 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scp2P32020 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scp2P32020 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scp2P32020 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scp2P32020 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scp2P32020 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scp2P32020 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scp2P32020 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scp2P32020 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scp2P32020 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scp2P32020 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scp2P32020 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms