Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc11P31313 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc11P31313 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms