Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd28P31041 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd28P31041 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd28P31041 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd28P31041 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd28P31041 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd28P31041 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms