Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk4P30285 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms