Protein–RNA interactions for Protein: P28651

Ca8, Carbonic anhydrase-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca8P28651 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca8P28651 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca8P28651 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca8P28651 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca8P28651 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca8P28651 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca8P28651 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca8P28651 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ca8P28651 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ca8P28651 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ca8P28651 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ca8P28651 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ca8P28651 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ca8P28651 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca8P28651 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca8P28651 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ca8P28651 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ca8P28651 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca8P28651 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca8P28651 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca8P28651 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca8P28651 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca8P28651 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca8P28651 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ca8P28651 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms